結合蛋白質：
色蛋白：蛋白質和色素物質結合，如血紅蛋白。
卵磷蛋白：蛋白質與卵磷脂相結合，如血液中的纖維蛋白、卵黃磷蛋白。
脂蛋白：溶于水，是脂肪與蛋白質結合，脂蛋白是人體在體內運輸脂肪的工具。包括乳糜微粒、極低密度脂蛋白、低密度脂蛋白、高密度脂蛋白。
金屬蛋白：蛋白質與金屬結合，如運鐵蛋白、銅鋅結合蛋白，有很多種酶類都含有金屬離子。
粘蛋白或糖蛋白：含有碳水化合物如甘露糖和半乳糖的蛋白質，人體細胞組織分泌的粘液含有粘蛋白。
核蛋白：蛋白質與核酸結合，核蛋白存在于組織胚芽和人體腺體組織中。