飼養淡水魚的水源種類較多，象井水、自來水、江河、湖水等，都是易于獲得的水源。但是水質的差別以及魚體本身適應性的限制，都要求水在獲得后必須經過處理才能使用。一般可以根據水質的不同情況，處理24－48小時，使其接近水族箱中飼水的水質，然后再競入水族箱。 　　井水冬暖夏涼，PH值約為7－7.6，適合飼養金魚，特別是淺井水，一般可經12－36小時暴曬后使用。自來水由于經過了人工殺菌等處理，含氧低、含氯高，所以使用前必須經過48小時以上的曝曬，促使氯氣揮發后再使用，也可按每立方米水加入太蘇打（硫代硫酸鈉）2－3克，來去除水中的氯，天然的江、河、湖水PH值約為7－8，含氧量高，但水中的微生物和寄生蟲較多，而且天然水源易受有毒物質的污染，威脅魚類的健康所以使用前必須選過濾，此外，泉水也是很好的飼水來源，含有豐富的礦物質但在使用前需要注意按要求調整水的硬度和溫度，雨水也可謂天然的蒸餾水，水質軟，PH值約為7，是很好的飼水，只是容易吸附空氣中的雜質，如果降雨的地區沒有受到污染，雨水還是很純凈的，但是使用前也應經過曝曬處理。 　　海水熱帶魚對水質的要求較淡水魚復雜得多，除了上面介紹的水質條件外，還要求有適當的鹽度和比重。自然界海水的含鹽濃度在溫度為15攝氏度時，約為34－35%，比重約為1.024－1.025（波美度3.3－3.4）。隨著溫度的增高，海水的比重應以低于自然海水的比重為佳，以減少對魚的刺激，在飼養海水熱帶魚的水族箱中，25攝氏度時的海水濃度應為3%，比重為1.020（波美度為2.8－2.9）。天然海水在使用前也要經過處理。最常用的處理方法是將天然海水置于避光、恒溫的地方至少3周，使海水中的生物變化和化學變化逐漸穩定下來，在裝入水相前，還要用虹吸管清除盛器底部的沉淀，充入氧氣，調定水濁再使用。取天然海水時還要注意，退潮時的海水不如漲潮時的好，而且最好不要取用大雨和臺風過后的海水。現在市售人工海水的效果并不亞于天然海水，不論是粉狀的，液裝的還是混合狀的，只需參照說明書，加入所需的自來水，即可配出符合海水熱帶魚要求的水質。