甘薯含水量大，儲藏時要求環境相對濕度85-90%,濕度過小易糠心，濕度過大易引發病害。對溫度要求也很嚴格，高于18℃易生芽，低于10℃易腐爛。儲藏甘薯最常用的方法是窖藏，有以下幾個關鍵環節。

    新窖建立：選擇地勢較高、土層深厚堅硬的地方建窖，窖深4米左右，兩個儲藏洞高1.8米，長、寬均為2.5米，可儲藏甘薯5000公斤。也可以利用舊窖儲藏。

    窖內消毒：⑴用2%石灰水涂窖壁。⑵每立方米燃燒硫磺5克熏蒸，密閉2-3天后通風。⑶用50%多菌靈1000倍液或50%硫磺懸浮劑800倍液對窖內噴灑，以噴濕窖壁為度。舊窖洞應先挖去表土（以見新土為度）.如果窖內干燥，可潑些清水。

    及時入窖：收獲后曬2-3天，曬干表皮，剝去泥土。剔除斷傷、帶病、受凍、受澇、有蟲孔和傷皮嚴重的薯塊。用50%多菌靈膠懸劑400倍液浸泡10分鐘，晾干后入窖。堆放高度以離洞頂60厘米為宜，以保證窖內氧氣能維持薯塊正常生理活動。

    窖內管理：入窖初期氣溫高，甘薯呼吸旺盛，放出二氧化碳并產生熱量，使窖內溫度升高。此時如通風不良，薯塊在缺氧條件下會被迫進行缺氧呼吸而引起酒精中毒，導致爛薯。入窖后2-3天，窖溫控制在16-18℃，保持10-12天后逐漸降至12-13℃。窖內溫度低于10℃時，在封嚴窖口的基礎上加蓋覆蓋物；窖溫高于15℃時適當通風降溫。窖內相對濕度保持80-90%.儲藏初期濕度大時敞開窖口通風，后期濕度小時可噴灑清水。