導致大蔥干黃葉的病蟲害很多，有霜霉病、灰霉病、疫病、病毒病、種蠅等，既然打了治霜霉病、灰霉病、疫病的藥沒效果，大蔥得病毒病和受種蠅為害的可能性最大，可根據具體癥狀加以防治。

病毒病癥狀為：葉片上出現長短不一的黃綠相間的斑駁或黃色條斑，葉片扭曲變細，葉尖逐漸黃化，發病較重時，大蔥生長變慢或停止最后全株死亡。大蔥發病初期，用1.5%植病靈乳劑1000倍液20%鹽酸嗎啉胍、乙酸銅可濕性粉劑500倍液10%混合脂肪酸乳劑100倍液噴霧防治，間隔7～10天，連噴2～3次。

種蠅為害：以幼蟲在地下鉆柱大蔥根莖，造成地下部分腐爛發霉，地上部分萎蔫，葉尖枯黃或全株葉片變黃，嚴重時，大蔥停止生長甚至死亡。可用75%滅蠅胺可濕性粉劑3000倍液、40%辛硫磷乳油3000倍液、48%毒死蜱乳油3000倍液、5%氟鈴脲乳油3000倍液灌根，防治種蠅幼蟲為害。