食用菌菌種在培養(yǎng)過程中均會(huì)不同程度的發(fā)生諸如綠霉、青霉、曲霉、根霉、毛霉以及細(xì)菌等雜菌污染，高溫季節(jié)尤為嚴(yán)重。生產(chǎn)過程中由于雜菌的侵害，往往會(huì)引起減產(chǎn)甚至絕收。因此，尋找雜菌污染的原因，對(duì)于提高栽培的成功率和提高經(jīng)濟(jì)效益具有重要的意義。正常情況下，二級(jí)菌種和三級(jí)菌種的污染率在5%以下，如果超出了這一范圍，就需要我們查找原因了。造成菌種污染的原因如下：

（1）滅菌不徹底：培養(yǎng)料滅菌不徹底會(huì)造成雜菌污染，一般3-5天即可出現(xiàn)污染現(xiàn)象。而滅菌不徹底也是由于下列幾個(gè)原因引起的：

①霉菌操作不當(dāng)：一般雜菌的菌絲體與孢子經(jīng)過常壓100℃、6-8小時(shí)或121℃、0.5-2小時(shí)均能殺死。目前食用菌培養(yǎng)料往往采用常壓滅菌法或高壓滅菌法。常壓滅菌對(duì)谷粒、糞草等材料的滅菌難度較大，不容易完全達(dá)到滅菌的效果；而高壓滅菌法效果則要好得多。采用高壓滅菌時(shí)，關(guān)鍵是把鍋內(nèi)冷空氣排盡，否則，鍋內(nèi)不能達(dá)到飽和的蒸汽壓，滅菌的溫度也達(dá)不到要求。采用常壓滅菌時(shí)，滅菌倉的周圍最好砌成圓形，以便灶內(nèi)升溫均勻，灶頂砌成圓拱形，這樣冷凝水沿四壁下流而不會(huì)打濕菌種瓶（袋）。另外蒸汽不足、溫度不高等也是常壓滅菌不徹底的因素。

②培養(yǎng)料性質(zhì)的影響：制種所需材料的種類、培養(yǎng)料中的含菌量、含水量以及酸堿度等都能影響滅菌效果。滅菌時(shí)，要根據(jù)培養(yǎng)料配方的不同，選擇相應(yīng)的滅菌時(shí)間。選用的培養(yǎng)料一定要新鮮無霉變。從培養(yǎng)料滅菌前微生物含量來看，微生物數(shù)量越高則滅菌時(shí)間越長，反之則短，所以培養(yǎng)料配制完畢后必須及時(shí)滅菌，裝袋后的菌種千萬不要過夜后再上鍋滅菌，以免微生物大量繁殖，導(dǎo)致料內(nèi)的含菌量升高，并且會(huì)造成料中營養(yǎng)損失。水的熱傳導(dǎo)性能比木屑、糞草等固體要強(qiáng)，如果培養(yǎng)料內(nèi)水分均勻適宜，則滅菌效果好。培養(yǎng)料中應(yīng)避免出現(xiàn)"夾心料"（即培養(yǎng)料中含有未吸水的干料）。滅菌鍋內(nèi)的蒸汽對(duì)夾心料的穿透能力較弱，容易出現(xiàn)滅菌死角，達(dá)不到滅菌的目的。另外，培養(yǎng)料的酸堿度也影響滅菌的效果，偏酸的培養(yǎng)料比中性和偏堿性的滅菌時(shí)間要短。

③菌種瓶（袋）堆放不當(dāng)：菌種瓶（袋）在滅菌鍋內(nèi)的堆放形式可影響滅菌的效果。在排放時(shí)要留有一定的空隙，以便蒸汽的流通和升溫。對(duì)菌種袋裝的培養(yǎng)料滅菌時(shí)，由于塑料袋受熱后容易變形變軟，如裝料不緊，疊壓堆放時(shí)則菌袋之間的空隙會(huì)減少，影響滅菌的效果。

④菌種瓶或菌種袋的影響：制種時(shí)一般選擇菌種瓶或菌種袋。塑料袋傳熱速度快，而玻璃瓶則傳熱速度慢，在相同培養(yǎng)料，使用相同的滅菌方法時(shí)，瓶裝料要比袋裝料滅菌時(shí)間稍長一些。另外，個(gè)別容器密封不嚴(yán)或細(xì)小破損，也可以導(dǎo)致雜菌的污染。

（2）接種操作不規(guī)范：食用菌接種過程需要嚴(yán)格的無菌操作，如操作不規(guī)范則極易造成培養(yǎng)料的雜菌污染。污染的雜菌一般是接種室空氣中雜菌、菌袋表面的雜菌以及接種人員的體表雜菌等。操作不規(guī)范引起培養(yǎng)料污染的特點(diǎn)，是雜菌在培養(yǎng)料表面生長，一般發(fā)生在菌袋開口處以及接種處。因此必須要嚴(yán)格遵守?zé)o菌操作規(guī)程，接種室要用"菌室專用消毒王"進(jìn)行嚴(yán)格的消毒處理。

（3）菌種帶雜菌：用于擴(kuò)大培養(yǎng)的原種本身必須是純菌，這樣才能保證菌種的單一性。如果菌種本身不純，可造成批量污染，生產(chǎn)中的一批菌種中，集中在一起的菌種都出現(xiàn)污染，而且污染的部位在菌種塊處，污染出現(xiàn)較早，接種3-5天即可出現(xiàn)。因此我們在制種時(shí)應(yīng)盡量采用生活力強(qiáng)、菌齡適宜、抗逆性強(qiáng)的優(yōu)良菌種原種。

（4）培養(yǎng)室不潔凈：培養(yǎng)料不潔凈、空氣不流通、室內(nèi)潮濕，也可感染雜菌。這種情況下污染率相對(duì)較低，但隨著培養(yǎng)時(shí)間的延長，污染率會(huì)逐漸增加。大量污染出現(xiàn)比較晚，一般在接種10天后出現(xiàn)。