首先、溫室是封閉性設施，室內有害氣體不易排除，如基肥使用量偏多，揮發的氨氣多，室內蔬菜要遭受氨氣危害，使葉片干邊或發生枯斑，嚴重時葉片枯萎，直至死棵現象發生。

第二、蔬菜在進入開花結果期以前，其吸肥量僅為全生育期吸肥總量的1/6左右，此時期土壤肥料不宜多，多了不但引起燒苗現象發生，還易引起幼苗旺長，影響花芽分化，延遲結果時期。

第三、溫室蔬菜因長期施肥量較大，土壤中各種營養元素并不缺少，缺少的是二氧化碳。而作物在幼苗期對二氧化碳的需求量很少，它是隨著葉片數量增加逐漸增多的，進入結果盛期，對二氧化碳的需求量達到高峰。溫室內的二氧化碳主要來自土壤中有機肥料的分解，有機肥料施入土壤后，其二氧化碳釋放盛期大約在施肥后10～50天之間。大量的施用基肥，不但會引起燒苗現象發生，而且釋放的二氧化碳因作物生育前期用量很少，絕大多數都浪費掉了。進入結果期后，需要的二氧化碳增多了，而此期土壤中二氧化碳釋放盛期已過，二氧化碳供應不足，制約了光合效能的發揮，影響了產量的提高。