食用仙人掌雖耐瘠薄，但對于疏松、肥沃的土壤仍是情有獨鐘，對肥料的要求：一是完全腐熟；二是不含過多鹽類；三是氮肥為主，磷鉀肥為輔。基肥可采用腐熟的雞糞、牛糞、豬糞、人糞或餅肥。如果施無機肥，多用氮磷鉀三元素復合肥，也可用尿素和碳銨，每畝用量１０公斤。可溶于水后使用，也可在行間開穴施入。春秋兩季是仙人掌生長旺盛期，可每１５天施肥一次；夏季高溫期，仙人掌處于半休眠狀態，宜暫停施肥；秋冬天氣轉涼，仙人掌生長緩慢，僅可少量施以淡薄肥水；冬季注意節制施肥。施肥可與澆水有機結合，晴天要選擇在早晨或傍晚時進行。

對食用仙人掌施肥要遵循以下幾個原則：(1)隨仙人掌生長年齡逐年增大而增大用量；(2)有機肥、無機肥合理搭配；(3)寧淡勿濃、薄肥勤施；(4)施肥數量配比均依生長和土地肥瘦等具體情況而定，不可機械照搬。