噴藥、熏煙、灌根是防治病害最為常用的方式。噴藥，能及時有效地防治蔬菜葉片、果實、莖稈等部位上的多數病害；熏煙，能使藥劑均勻擴散到大棚內，防病更全面；灌根能使藥劑與作物根部、土壤直接接觸，殺滅病原菌。

噴藥、熏煙、灌根，可以說各有各的優勢。因而，合理應用這些方式，或者說將這些方式合理地配合起來，可起到事半功倍的療效，是藥劑防治蔬菜病蟲害的重要內容。

如番茄細菌性髓部壞死病，在番茄莖稈內發展，為害番茄髓部。若單采用噴藥，則很難控制病情的發生發展。其原因有二：一是銅制劑等防治細菌病可謂特效，但內吸性差，感病部分在髓部，噴施防治效果自然就差；二是抗生素類藥劑，如鏈霉素，雖內吸性較好，但治療效果差，因而單獨噴施防治效果也不好。

而如果采用噴、灌結合，上噴下灌，則藥液更容易傳導或滲透至患病部分，治療和預防效果會顯著提高。灌根可用DT（琥膠肥酸銅）、喹啉銅等；噴藥可用加瑞農。發病嚴重時，也可用針管灌入莖稈，防治病害。

再如，絲瓜爛花是令菜農最為頭痛的一種病情。不僅是因為造成絲瓜爛花的病因多，還因絲瓜花嬌嫩，易發生藥害而干邊。所以，在用藥防治時必須講究用藥方式的配合，也不能單靠噴藥來解決。實踐證明，噴藥與熏煙結合防治絲瓜爛花效果顯著。

為防止病原孢子擴散傳播，全面殺滅病原，可在用藥的前一天晚上閉棚熏煙。煙劑可選用腐霉利煙劑、百菌清煙劑等，也可熏用菌核凈，但用量不宜過大，以免引起藥害，熏煙時間最好控制在8小時以內。第二天下午再進行噴藥。針對不同病害，對癥用藥進行噴藥防治。如綿腐病可用普力克、甲霜靈等，菌核病可用撲海因、和瑞等。