（1）下子葉部為高等植物的胚性器官，從子葉著生處以下生出的最初莖的部分。下邊經過莖根過渡區與幼根相連。兩者從外部形態方面根據有無黑色色素沉著（柿的胚根為藍黑色）、梭的存在（菜豆）、粗細不同（小豆的胚根急劇變細）等往往可以區別。而子葉上部的莖性器官則稱為上胚軸。

　　（2）指胚胎上假想的軸。最初設想在胚軸的時期可隨動物種類而有快有慢，并且是由卵的構造來決定的。在未受精卵已經有左右對稱的頭足類和昆蟲類中卵軸與胚軸一致。在海鞘或蛙類，是在精子進入的同時引起卵物質的移動而決定著對稱面，以顯示出以后的胚軸。另外這些卵，第一卵裂面在許多個體中是包含胚的主軸。海膽類、鳥類要根據原腸胚期出現器官原基，才可以開始設想有胚軸。