座位不同的二個(gè)或者二個(gè)以上的基因，具有表現(xiàn)相同性狀作用時(shí)稱為同效基因（H．Nilsson-Ehle，1909）。各基因之間的作用有互補(bǔ)和累加二種，如把車前草的具斑紋的系統(tǒng)與正常的綠色系統(tǒng)雜交，F₂綠色對(duì)斑紋之比為15∶1。這里假定有不連鎖的二對(duì)等位基因，只要帶有其中一個(gè)顯性基因這個(gè)個(gè)體就成為綠色，也就是說二對(duì)等位基因中各自的顯性基因，作用上是相互等同的，都能顯示充分的顯性效應(yīng)，或是當(dāng)一對(duì)基因中有顯性基因而第二對(duì)基因中全是隱性基因時(shí)，照舊可顯示其顯性作用，這樣就可說明出現(xiàn)15∶1分離的原因。這時(shí)，在表現(xiàn)程度上與顯性基因的數(shù)目多少?zèng)]有關(guān)系，但小麥的籽粒顏色的遺傳則與三對(duì)同效基因有關(guān)，然而由于各別的顯性基因的作用可以等價(jià)地累加，因此在F₂中顏色的深淺可以分離成6個(gè)等級(jí)。即使在具有同樣數(shù)量的顯性基因的等級(jí)之中，由于環(huán)境不同也有差異，所以事實(shí)上就表現(xiàn)為連續(xù)的變異。這一連續(xù)性隨著同效基因?qū)��?shù)目的增加而變得更為顯著。對(duì)數(shù)目很多的同效基因則稱為同效多基因。多基因也被看作為數(shù)目很多的同效基因。同效基因有n對(duì)時(shí)，在F₂中產(chǎn)生的純合隱性性狀的個(gè)體的分離比是（1／2）^2m（例如同效基因是三對(duì)時(shí)分離比是1／64，是4對(duì)時(shí)則為1／256）。如果使分離的各等級(jí)的后代進(jìn)行自體繁殖，就可以識(shí)別這些等級(jí)是同效基因還是環(huán)境變異所造成。當(dāng)有關(guān)的同效基因數(shù)目不多時(shí)，根據(jù)F₂的各等級(jí)的分離比能推斷出有關(guān)同效基因的數(shù)目。