將屬于各系統(tǒng)、各族系的生物所表現(xiàn)的體制以及器官形態(tài)加以比較而賦予體系的形態(tài)學的一個分支學科。是比較形態(tài)學的主要分支學科，對具有多樣性特點的生物來說，進行比較觀察是不可缺少的，可以追溯到古代。根據(jù)多數(shù)事實形成基本概念從而形成獨立的學科是在十八世紀以后。創(chuàng)始期的學者可以列舉如FeliX Vicq d’ Azyr（1748-1795）居維葉、杰弗里圣希萊爾（G．L．Cuvier， E．Geoffroy Saint-Hilaire）等一些人的名字，以后發(fā)展成所謂純形態(tài)學或觀念論形態(tài)學的流派的除圣希萊爾（Saint-Hilaire）之外，還有梅克爾、戈耶塞、 繆勒、歐文（J．F．Meckel．J．W．von Goethe，J．Mü-er，R．Owen）等。在達爾文創(chuàng)立進化論的同時，比較解剖學受到了顯著的影響。比較解剖學的資料被理解為是表明形態(tài)系統(tǒng)發(fā)生發(fā)展的跡象，與比較發(fā)生學、古生物學并列，已成為進化生物學的重要組成部分。里斯克爾和戈登巴爾（E．Haeckel、K．Ge-genbaur）等是這個時期的代表學者。比較解剖學雖然主要適用于現(xiàn)代生物，但從廣義來說，對古生物也是適用的。