肌鈣蛋白由3個多肽，即肌鈣蛋白T(Tn-T) 、肌鈣蛋白I(Tn-I) 、肌鈣蛋白C(Tn-C)組成的復合物。Tn-T(MW 37,000)是一種長形的纖維狀分子, 長度大約是肌鈣蛋白的三分之一, Tn-I和Tn-C都是球形分子。Tn-I(MW22，000)能夠同肌動蛋白以及Tn-T結合, 它與肌動蛋白的結合就抑制了肌球蛋白與肌動蛋白的結合。Tn-C(MW18，000)是肌鈣蛋白的Ca2 結合亞基，在序列上同鈣調蛋白以及肌球蛋白的輕鏈相類似，Tn-C控制著原肌球蛋白在肌動蛋白纖維表面的位置。在細肌絲上大約每隔40nm就結合有一個肌鈣蛋白。