細胞質遺傳是由細胞質中的遺傳物質控制的性狀遺傳方式。與核遺傳不同，不遵循遺傳的基本規律。細胞質基因控制的性狀在遺傳中，后代總是表現出母本相似的性狀。其原因是受精卵細胞質中的遺傳物質都是來自卵細胞，即受精卵中的細胞質都是來自母方，父方不提供細胞質中的遺傳物質，只提供細胞核中的遺傳物質，雄配子對此性狀不發生影響。在研究細胞質遺傳時，正交和反交的結果是不同的。如果假定甲品種作父本和乙品種作母本相交定為正交，則以乙品種作父本和甲品種作母本相交則為反交，如果正反交結果不同，可判斷為細胞質遺傳。