在聚丙烯管中可以對多種含膜板材料進行PCR，而在顯微玻片上用組織細胞涂片或切片直接進行DNA擴增的方法就稱為玻片PCR（Slide-PCR）。
　　先將細胞涂片或呈單層細胞，然后用甲醇/醋酸（3：1，V/V）、Carnoy溶液、無水乙醇或4%多聚甲醛溶液固定5～15min。用蒸餾水沖洗，干燥，直接使用或保存于-20℃備用。在玻片上劃20mm×28mm為免疫組化反應區。加入30μl PCR反應混合液，其中含10mmol/L Tris pH8.3,50mmol/L KCl,1.5mmol/L MgCl2,200μmol/l dNTPs,100nmol/L引物，0.01%（V/V）明膠，0.2% BSA, 2.5u/100μl Taq酶。然后蓋上22mm×40mm的蓋玻片，邊緣用石蠟油封好。把玻片放入PCR熱循環儀金屬塊上，使金屬塊與樣品呈最大程度接觸，同在聚丙烯管中一樣，進行30～40個循環。對于較短的擴增片段在后期循環中變性溫度可降低。反應后，將致冷玻片放在氯仿中除去大部分石蠟油，但不取出蓋玻片，用一個尖鑷子輕輕拈起蓋玻片一角，在相對的一角中PCR反應混合液呈半月形液面，用移液器回收。一般可回收25μl混合液，將反應產物進行瓊脂糖電泳或用套式PCR引物按標準PCR進行重新擴增。片上擴增物可做原位雜交顯示。
　　在Slide-PCR中，需0.1%～1%的BSA。加入BSA可以保證擴增結果，但效率不一定很高。明膠（至少0.0001%）,對擴增1kb左右的靶DNA十分重要。但對小片段擴增結果影響不大。不同的樣品提取方法或固定法對Slide-PCR都可行。
　　Silde-PCR的機理可能是在起始變性過程中一部分DNA從細胞中洗提出來，然后在細胞和玻片的水相中進行PCR。用地高辛標記的人全基因組DNA探針雜交表明在起始循環中DNA極微量，而30個循環后很豐富。常規細胞染色表明只有少量的形態改變。
　　Silde-PCR對于玻片上的細胞樣品提供了一種較好的方法，而不必再把這些樣品從玻片上括下來，使操作簡便，污染減少。本方法對于原樣品量極微且需病史追蹤保存的（如子宮頸涂片或涂片）具有實用價值。