各種桿菌的大小、長短、彎度、粗細差異較大。大多數桿菌中等大小長2～5um，寬0.3～1um。大的桿菌如炭疽桿菌(3～5um×1.0～1.3um),小的如野兔熱桿菌(0.3～0.7um×0.2um)。菌體的形態多數呈直桿狀，也有的菌體微彎。菌體兩端多呈鈍圓形，少數兩端平齊（如炭疽桿菌），也有兩端尖細（如梭桿菌）或未端膨大呈棒狀（如白喉桿菌）。排列一般分散存在，無一定排列形式，偶有成對或鏈狀，個別呈特殊的排列如柵欄狀或v、y、l字樣。