雞糞是一種比較優質的有機肥，其含純氮、磷（P2O5）、鉀（K2O）約為1.63％、1.54％、0.085％。但是雞糞不被處理或腐熟而直接施用到作物上，則存在很大的害處及隱患，主要表現在：①傳染病蟲害。糞便中含有大腸菌、線蟲等病菌和害蟲，直接使用會導致病蟲害的傳播、作物發病，對食用農產品的人體健康也產生影響；未腐熟有機物料在土壤中發酵時，容易滋生病菌與蟲害，也導致植物病蟲害的發生；②發酵燒苗。不發酵的生糞等有機物料施到地里后，當發酵條件具備時，在微生物的活動下發酵，當發酵部位距根部較近且作物植株較小時，發酵產生的熱量會影響作物生長，燒毀作物根系，嚴重時導致植株死亡。③毒氣危害。在分解過程中產生甲烷、氨等有害氣體，使土壤和作物產生酸害和根系損傷。④土壤缺氧。有機質在分解過程中消耗土壤中的氧氣，使土壤暫時性的處于缺氧狀態，會使作物生長受到抑制。⑤肥效緩慢。未發酵腐熟的有機肥料中養分多為有機態或緩效態，不能被作物直接吸收利用，只有分解轉化成速效態才能被作物吸收利用，所以未發酵有機肥直接施用時使肥效減慢。