雜交后代的個體中出現了親代所沒有的基因組合的現象。有兩種情況可使雜交后代出現新的基因組合的個體（重組體）：（1）非連鎖基因的自由組合。例如純合的非糯紅米水稻品種與糯性白米水稻品種雜交，子二代有四種類型的植株，其中非糯紅米和糯性白米的植株分別與兩親本的性狀相同，稱為親本組合；另有非糯白米和糯性紅米兩種植株則是兩親本所有沒有的重新組合，即重組體。（2）連鎖基因的交換。例如，已知玉米種子的有色對無色為顯性，飽滿對凹陷為顯性，用純種有色飽滿玉米與無色凹陷玉米雜交，子一代種子均為有色飽滿，以F1與雙隱性（無色凹陷）親本回交，結果也出現四種類型，其中有色飽滿和無色凹陷為親本組合，約占96％；有色凹陷和無色飽滿為新組合（重組體），約占4％，后者就是同源染色體的非姊妹染色單體上部分基因發生了交換的結果。